提到“微生物質(zhì)譜”,不妨把這一詞組拆開(kāi)來(lái)看,“微生物”大家都懂,就不多說(shuō)了,那么“質(zhì)譜”到底是啥?
質(zhì)譜分析是一種通過(guò)測量離子質(zhì)荷比(質(zhì)量-電荷比),從而確定其質(zhì)量的分析方法(通俗點(diǎn)講,質(zhì)譜就是一種類(lèi)型的“秤”,只不過(guò)它稱(chēng)量的是離子的質(zhì)量),在眾多的分析測試方法中被認為是一種同時(shí)具備高特異性和高靈敏度且得到了廣泛應用的普適性方法。
質(zhì)譜儀器一般由進(jìn)樣系統、離子源、質(zhì)量分析器、檢測器、數據處理系統等部分組成。由于進(jìn)樣方式、離子源、質(zhì)量分析器等的不同,質(zhì)譜儀分為不同的種類(lèi),臨床上常見(jiàn)的有液相色譜串聯(lián)質(zhì)譜(LC-MS-MS)、氣相色譜串聯(lián)質(zhì)譜(GC-MS-MS)、電感耦合等離子體質(zhì)譜(ICP-MS)、基質(zhì)輔助激光解吸電離飛行時(shí)間質(zhì)譜(MALDI-TOFMS)等等。
我們通常所提到的微生物質(zhì)譜法采用的就是基質(zhì)輔助激光解吸電離飛行時(shí)間質(zhì)譜(MALDI-TOFMS)技術(shù)對微生物進(jìn)行鑒定的方法。
MALDI-TOFMS的離子化方式是基質(zhì)輔助激光解吸電離(MALDI),是一種“軟電離”的方式,這種電離方式可以產(chǎn)生穩定的分子離子,因而是檢測生物大分子的有效方法,廣泛地運用于生物化學(xué),尤其對蛋白質(zhì)、核酸的分析研究已經(jīng)取得了突破性進(jìn)展。
MALDI-TOFMS的儀器結構
那么,MALDI-TOFMS是如何進(jìn)行樣本檢測的呢?首先,用一定強度的激光照射樣品與基質(zhì)形成的共結晶薄膜,基質(zhì)從激光中吸收能量,與樣品之間發(fā)生電荷轉移使得樣品分子電離。離子在高壓電場(chǎng)作用下加速進(jìn)入飛行管中,小離子飛得快,先到達探測器,大離子飛得慢,后到達探測器,從而得出測定結果。
MALDI-TOFMS的工作原理
2.質(zhì)譜為什么能夠鑒定微生物?
以細菌為例,細菌是原核生物的一類(lèi),是一類(lèi)形狀細短,結構簡(jiǎn)單,多以二分裂方式進(jìn)行繁殖的原核生物,是在自然界分布*、個(gè)體數量最多的有機體,是大自然物質(zhì)循環(huán)的主要參與者。細菌主要由細胞膜、細胞質(zhì)、核質(zhì)體等部分構成,有的細菌還有莢膜、鞭毛、菌毛等特殊結構。
細菌結構
MALDI-TOFMS之所以能夠對細菌進(jìn)行鑒定,是因為細菌的核糖體蛋白具有保守性,一般不會(huì )隨生長(cháng)條件的變化而變化,而不同細菌的核糖體蛋白指紋圖譜具有各異性,指紋圖譜中的某些峰具有屬、種,甚至亞種特異性。另外,同種細菌在同一培養條件下生長(cháng),所得到的質(zhì)譜結果具有可重復性,這使得MALDI-TOFMS鑒定細菌結果更加準確。
腸桿菌的質(zhì)譜結核分枝桿菌的質(zhì)譜不同菌種的蛋白指紋譜MALDI-TOFMS鑒定細菌基本流程是,將細菌純培養后,點(diǎn)靶加釋放液,細菌經(jīng)過(guò)釋放液充分處理后,可使得細胞內的蛋白成分更好地釋放出來(lái),待溶劑揮發(fā)后加基質(zhì),蛋白分子與基質(zhì)形成基質(zhì)結晶,上質(zhì)譜檢測。在質(zhì)譜儀中,樣品通過(guò)有效的電離將不同質(zhì)荷比(m/z)的離子分開(kāi)形成細菌特異性的清晰的指紋圖譜,通過(guò)分析關(guān)鍵的質(zhì)譜峰數據,與數據庫中的已知菌種譜圖進(jìn)行比對,即可快速得到細菌鑒定結果。
微生物質(zhì)譜鑒定操作流程
3.為什么要用質(zhì)譜做微生物鑒定?
那么,為什么要用質(zhì)譜做微生物鑒定,而不是別的方法?這就要先來(lái)說(shuō)一說(shuō)目前的微生物鑒定方法。
目前微生物鑒定常用的方法為生化原理檢測,即先判斷革蘭氏陰性還是陽(yáng)性,再根據形態(tài)、酶反應、顯色等不同方法,將具體微生物種類(lèi)鑒定出來(lái)。
對于絕大多數的微生物檢測有一個(gè)繞不開(kāi)的環(huán)節,那就是標本處理和培養。需要首先對樣本進(jìn)行預處理,根據涂片染色的結果選擇合適的培養基分離培養,然后根據菌落特點(diǎn),選擇適當的生化反應或者自動(dòng)儀器鑒定。
然而,生化法微生物檢測樣品培養時(shí)間長(cháng),短到幾小時(shí),長(cháng)到幾天都有可能;只能鑒定常規菌種,準確度一般;另外,就是鑒定流程較復雜,離不開(kāi)人工干預,耗時(shí)長(cháng)(十幾個(gè)小時(shí)甚至更長(cháng))。
由于鑒定原理的不同,微生物質(zhì)譜法可大大簡(jiǎn)化微生物的鑒定流程,縮短鑒定時(shí)間,上機之后,基本10min之內就可以鑒定出96個(gè)樣本,稱(chēng)得上是一種微生物快速鑒定方法。
理論上,微生物質(zhì)譜的數據庫可以無(wú)限大(當然這也只是在理論上)。目前市面上的微生物質(zhì)譜產(chǎn)品數據庫少則含有2000余種微生物,多的也有超4500余種的(例如融智生物的QuanID微生物質(zhì)譜系統),遠遠大于生化法的數據庫種類(lèi)。而且,數據庫可擴展,用戶(hù)可根據需要自建庫。
QuanID微生物質(zhì)譜系統
另外,而且是最重要的一點(diǎn),就是微生物質(zhì)譜鑒定的準確性高。除了得益于超大的數據庫外,質(zhì)譜硬件的性能也是鑒定準確性的保證。QuanID微生物質(zhì)譜系統依托于融智生物新一代寬譜定量飛行時(shí)間質(zhì)譜平臺QuanTOF(新一代的MALDI-TOFMS),檢測質(zhì)量范圍更寬(10-1000,000Da),重現性更高(SD<5%),保證了微生物鑒定結果的高準確性。
此外,QuanID微生物質(zhì)譜系統的數據庫還有一個(gè)*之處,就是分為一級、二級兩個(gè)數據庫,二級菌庫涵蓋100多種相似病原體,可對基因型相近的難分辨微生物(如:大腸桿菌和志賀氏菌等)做出準確鑒定。(詳見(jiàn):QuanID突破微生物質(zhì)譜鑒定的局限性)
怎么樣,這3個(gè)問(wèn)題有沒(méi)有讓你對微生物質(zhì)譜有了全面的了解呢?
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融智生物,由資深質(zhì)譜研發(fā)專(zhuān)家創(chuàng )立,是專(zhuān)業(yè)致力于生命科學(xué)分析儀器設備、耗材及解決方案的研發(fā)、生產(chǎn)、銷(xiāo)售、服務(wù)的高新技術(shù)企業(yè),注冊資本6000萬(wàn)元。公司在美國波士頓、北京、青島、深圳和杭州等地布局了研發(fā)、生產(chǎn)、應用開(kāi)發(fā)、銷(xiāo)售、服務(wù)等分中心,與中國農業(yè)大學(xué)、中國科學(xué)院等多家科研機構建立了聯(lián)合實(shí)驗室,并承擔了多項國家和地方科技創(chuàng )新研發(fā)項目。
作為一家擁有自主知識產(chǎn)權的研發(fā)型高科技企業(yè),公司成立以來(lái)累計研發(fā)投入超過(guò)5000萬(wàn)元,目前已擁有“寬譜定量飛行時(shí)間質(zhì)譜(新一代基質(zhì)輔助激光解吸飛行時(shí)間質(zhì)譜)”及“微流控芯片核酸快速分析”兩大技術(shù)平臺,其中“寬譜定量飛行時(shí)間質(zhì)譜平臺”被兩院院士組成的鑒定委員會(huì )鑒定為“整體性能達到水平”。
基于兩大核心技術(shù)平臺,融智生物開(kāi)發(fā)了微生物質(zhì)譜系統、核酸質(zhì)譜系統、糖化血紅蛋白定量質(zhì)譜系統、成像質(zhì)譜系統以及食源性致病菌快速檢測系統、呼吸道病原體檢測系統等系列產(chǎn)品,應用涵蓋臨床醫療、檢驗檢疫、食品安全、疾控等領(lǐng)域。公司已獲CFDA一類(lèi)醫療器械產(chǎn)品備案憑證15項,二類(lèi)醫療器械產(chǎn)品注冊證1項,醫療器械生產(chǎn)許可證1項,一類(lèi)醫療器械生產(chǎn)備案憑證2項。
扎根國內,放眼國際,成為具有國際競爭力的生物科技企業(yè)是融智生物的經(jīng)營(yíng)目標,融智生物將持之以恒地為生命科學(xué)儀器的國產(chǎn)化、國人醫療健康水平的提高做出貢獻。